衡阳市第三人民医院(衡阳市公共卫生临床中心)
HENGYANG THIRD PEOPLE'S HOSPITAL (HENGYANG PUBLIC HEALTH CLINICAL CENTER)
聚焦结核利福平耐药:Xpert和靶向二代测序优势互补
(通讯员:何梦麒) 利福平通过特异性结合结核分枝杆菌RNA多聚酶β亚基(rpoB基因编码),阻断菌体mRNA合成、抑制蛋白质表达,从而发挥杀菌作用。结核分枝杆菌利福平耐药主要源于rpoB基因突变,突变热点集中在426-452密码子的81bp区域,即利福平耐药决定区(RRDR)。
Xpert MTB/RIF基于荧光定量PCR探针杂交原理,针对rpoB基因RRDR核心区常见突变位点设计特异性探针。野生型序列可正常结合探针并产生荧光信号,判读为利福平敏感;当 RRDR区域发生突变时,探针结合受阻、荧光信号异常,以△Ct>3.5作为利福平耐药的判读标准。但该技术仅覆盖RRDR有限突变位点,无法识别区外突变及少见新型变异,存在固有检测局限。
二代靶向测序基本原理为边合成边测序,结核/非结核分枝杆菌鉴定及耐药靶向基因测序属于其中的一种,通过多重PCR富集核酸片段,经建库、高通量测序及生物信息学比对,可完整读取基因片段,实现耐药位点全覆盖检测。以临床常见的S450L耐药突变为例,rpoB基因第1349位胞嘧啶(C)突变为胸腺嘧啶(T)碱基替换,使第450位密码子编码的丝氨酸(Ser,S)突变为亮氨酸(Leu,L),改变RNA聚合酶空间构象,降低利福平结合能力,最终导致菌株耐药。
Xpert与二代靶向测序临床定位不同、互为补充。Xpert 操作简便、检测快速,适用于临床样本的快速初筛,但无法检出V170F、I491F等RRDR区外耐药突变,对P439L等沉默突变易出现假敏感结果,且无法区分高低耐药菌株与敏感菌混合感染。依据WHO耐药位点分级标准,二代测序可检出与耐药相关位点及V170F、I491F、P439L等暂定耐药位点,弥补Xpert 的技术短板,适用于疑难隐匿性耐药病例的精准分型。
临床工作中,Xpert用于快速初筛,二代测序用于疑难病例的全覆盖基因分析,二者联合可显著提升分子水平耐药检出效能。需注意,Xpert与二代测序均为基因水平间接耐药推断,表型药敏试验仍是结核分枝杆菌耐药判定的公认金标准,可对分子检测结果进行最终复核与确诊。
一审:王 莹
二审:欧 松